非淋的典型癥狀
　　
　　尿道刺癢、疼痛和燒灼感，伴有或輕或重的尿急、尿痛和排尿困難，但較淋病性尿道炎為輕。分泌物亦較淋病少、稀薄，自行流出現象很少見，當長時間不排尿或晨起首次排尿前，尿道外口可溢出少許粘液性分泌物，有時僅有薄薄的痂膜封口或褲襠污染，稍不細心則痂膜即被尿流沖失，檢查時尿道口的炎癥性水腫為主。同性戀患者則會引起直腸炎肛門灼熱，有粘液分泌物。還有些病人可無任何癥狀，由于發病緩慢，癥狀不典型，加之衣原體感染與其他病原所致泌尿系感染十分相象，白細胞不高，體溫正常，致使此類病人至少有60%以上初診時被誤診。
　　
　　非淋的并發癥
　　
　　1、附睪炎常與尿道炎同時存在。通常35歲以上的附睪炎由尿道內細菌積留引起，35歲以下的附睪炎中50%是由衣原體所致，附睪多為單側腫大，墜痛。
　　
　　2、本病是衣原體侵入人體所引起的變態反應性疾病。此推斷尚無充足論據。癥見前列腺部輕度疼痛，會陰部和外生殖器在性欲高潮時疼痛加重。肛門指檢前列腺腫大、柔軟。前列腺按摩液內無淋球菌、WBC5/HP以上。
　　
　　3、Reiter綜合征。極少數病人伴有，患者為血清HLA—B27單倍型抗原遺傳傾向者，表現為尿道炎、關節炎、角膜炎、結膜炎和皮疹