尿道炎的致病菌多為淋球菌和衣原體，而且本病在發病過程中并沒有明顯的臨床癥狀，患者往往是在檢查其他疾病時發現患有本病的。尿道炎的治療有一定的困難，這是因為：
　　
　　1、尿道炎要根據病原菌采用針對性用藥的原則。支原體和衣原體(主要感染微生物)是引起本病的主要原因，但諸如陰道毛滴蟲、白色念珠菌、金黃色葡萄球菌、鏈球菌、酵母菌、厭氧革蘭陰性桿菌等病菌也在本病的致病因素中占10%—20%。所以非淋的治療要因人而異，首先要確定致病的微生物，才能確定用藥。
　　
　　2、本病治療要有足夠的療程。支原體和衣原體是人體內的寄生的微生物，對抗生素并非很敏感，因而本病一般需要1—2周的治療期。
　　
　　3、本病治療最好僅選用一種藥物。非淋菌尿道炎的治療藥物除非知道它們之間有協同互補作用，否則不應該同時用兩種以上的藥物，否則藥物之間復雜的相互作用，會對本病治療產生不良影響。比如藥物之間有相互拮抗作用會降低療效，增加治療的費用，使病原菌對藥物的耐藥菌株增多，從而使進一步治療難度加大。
　　
　　4.性伴侶應檢查和治療。僅對患者一人進行治療，而忽視性伴侶，往往會造成反復的感染，這并不代表治療無效。
　　
　　5、要重視機體的抗病能力。機體抗病的配合才能使藥物治療取得較好的效果。如果患者能夠在治療期內戒酒并暫停性生活，能夠對藥物發揮療效產生好的效果。此外，還有生活節奏不規律、食辛辣火鍋等食物、過度勞累或慢性病等也不利于藥效的發揮。
　　
　　威海割包皮多少錢專家溫馨提示：尿道炎患者常常因不好意思就醫而自行服藥治療，這是不可取的，這樣不僅會導致細菌不能被殺滅，還會使其產生耐藥性。