一：輸精管畸形
　　
　　可分為先天性缺失、與輸尿管相交通及重復輸精管等多種情形。
　　
　　如果不并發(fā)其他畸形，只是單純性輸精管缺如時，病人性欲和性功能均正常，唯一癥狀是不育。臨床表現(xiàn)為無精癥，但血清激素水平均正常，可經(jīng)睪丸活組織檢查證實。如有可能，可行手術治療，將輸精管殘端與附睪進行吻合。
　　
　　二：陰囊異常
　　
　　（1）陰莖完全缺失。多合并尿道畸形，治療相當困難，過去施行陰莖成形術效果不好。最好切除睪丸，作尿道陰道成形術，青春期后以雌激素維持女性性征。
　　
　　（2）潛伏陰莖。因發(fā)育短小，而被會陰、陰囊、恥骨等處的脂肪所掩蓋，隨著發(fā)育過程中脂肪減少，陰莖才暴露出來。也可以通過整形手術把陰莖“解放“出來，就能恢復正常了。
　　
　　（3）先天性陰莖扭轉。陰莖扭轉時，尿道口方向改變。少數(shù)人可有勃起時的隱痛等癥狀。本癥還容易合并異常勃起。
　　
　　（4）雙陰莖。可平行排列或前后排列。
　　
　　（5）陰莖過大或過小。罕見。過大時可作整形術截短。過小的病因復雜，需針對病因適當處理。
　　
　　（6）包莖。可占男孩的25%以上，但成年人包莖明顯少于青少年。可分為生理性包莖、假性包莖（包皮過長）、真性包莖和嵌頓包莖。
　　
　　三：陰莖異常:可分為大小異常及位置異常。多與其他畸形同時出現(xiàn)。
　　
　　四：前列腺、精囊腺先天畸形
　　
　　（1）前列腺發(fā)育不全多與其他性器官發(fā)育不全合并存在。前列腺囊腫可并發(fā)排尿困難。
　　
　　（2）精囊腺缺如，合并不育癥，可由精漿果糖水平極低和精液量少作出初步判斷，并根據(jù)輸精管精囊腺造影術確診。
　　
　　五：睪丸畸形